自从半导体技术以及晶体管的出现以来，晶体管计算机便成为了计算机发展的方向。然而晶体管计算机也存在一些缺点，让它们成为这个时代的限制因素。
首先，晶体管计算机很消耗电量。晶体管比诸如芯片或其他微电子器件耗电量要高，而计算机使用晶体管的情况也不例外，使得电力消耗量又更加严重。
其次，晶体管计算机的结构相对复杂。晶体管计算机构成的最基本机构是半导体晶体管，而这些晶体管又是由源极、栅极、漏极以及控制极组成的，从而使得计算机的结构比起相对较新的芯片或其他微电子器件更加复杂，也使得计算机更加脆弱。
在此同时，晶体管计算机的计算速度也有所缓慢。晶体管计算机的计算电流可以通过晶体管实时控制，但由于晶体管器件具有迟缓的速度特性，因此计算机的计算速度也较其他器件为慢，从而使计算机的效率也相对较低。
另外，晶体管计算机的制造也是一项耗时也耗力的工作。晶体管器件具有极小的尺寸，因此在声明晶体管时需要借助晶片磊晶等工艺，且对于整块晶体管来说其连接的过程更是不可逾越，从而使得晶体管计算机的制造过程十分费时也费力。
综上，晶体管计算机虽然在历史上扮演着至关重要的角色，但由于上述原因，其有效的使用已经受到较大的制约，不得不表示，晶体管计算机是局限性不可忽视的。
